Летающая лодка Бе-12

Бе-12 (изделие «Е») Базовая модель с противолодочной системой ППС-12.

Бе-12Н (изделие «ЕН») Модификация с ППС «Нарцисс-12», 27 (или 28) самолётов .

Бе-12П (изделие «ЕП») Противопожарная модификация, четыре самолёта.

Бе-12П-200 Более современный вариант противопожарного самолёта. Была переоборудована одна машина, работала в Авиалесоохране. Утилизирована.

Бе-12ПС (изделие «ЗЕ») Поисково-спасательный вариант.

Бе-12СК (изделие «ЕСК») Модификация — носитель ядерного боеприпаса 5Ф-48 «Скальп». В дальнейшем переоборудован для применения более компактного заряда, также мог возить в грузовом отсеке 29 буев.

Бе-12НХ (народно-хозяйственный) Транспортно-пассажирская модификация Бе-12, в 1992 году, были переоборудованы три машины. Два самолёта эксплуатировались на Курильских островах, где были потеряны в авариях к 1993 году. Одна машина так и осталась на аэродроме в Таганроге.

Бе-14 (изделие «ЕПС») Модификация для поиска, спасения экипажей самолётов, потерпевших аварию над морем, и оказания помощи экипажам кораблей и судов, терпящих бедствие на море. Единственный самолёт, был переоборудован в поисково-спасательный из второго опытного изделия 2Е, затем передан на Балтику. Утилизирован.

Бе-12И (проект) Вариант самолёта для проведения различных исследований. Проект не реализован

Бе-12ЭКО (проект) Вариант самолёта для проведения экологического мониторинга. Проект не реализован